提出扶持農業農村發展的財政政策和項目建議，組織提出農業投資規模、方向的建議並監督實施；編報部門預算並組織執行；參與農村金融、農業保險的政策谘詢；指導監督局屬單位財務、資產和政府采購管理工作；組織開展農業財政及基本建設項目專項審計輔助工作；組織開展所屬單位負責人經濟責任審計和其他專項內部審計輔助工作；製定預算績效管理相關製度，組織開展預算績效管理及預算項目績效評價工作；負責農業三項補貼。