指導農用地、農業生物物種資源和農產品產地環境保護和管理；承擔農業野生植物資源保護和外來物種管理相關工作；指導農村可再生能源開發利用、節能減排、農業清潔生產和生態循環農業建設；負責秸稈綜合利用工作；承擔農村宅基地改革和管理有關工作；指導閑置宅基地和閑置農房利用；擬訂農田建設中長期規劃、管理製度、技術標準及規範；承擔高標準農田建設項目、農田整治項目、農田水利建設項目管理工作；承擔節水灌溉工程建設管理工作，承擔農業綜合開發有關國際合作項目年度計劃編製、組織實施和管理工作；組織編製耕地及永久基本農田質量建設與保護發展規劃，承擔相關項目年度計劃編製、組織實施等管理工作；組織開展耕地質量調查、監測和耕地質量等級評定，承擔永久基本農田保護相關工作；負責高標準農田建設新增耕地測算、認定工作；